В августе 1990 года состоялся I Съезд народных депутатов всех уровней населенных пунктов юга Молдавской ССР, где проживает преимущественно гагаузское население. На съезде приняли Декларацию о свободе и независимости гагаузского народа от Молдавской ССР и провозгласили Республику Гагаузию в составе СССР. Это событие, направленное на сохранение гагаузского народа от проявлений национализма со стороны официального Кишинева, стало реакцией на рост националистических и сепаратистских тенденций в руководстве и общественной жизни тогда еще советской Молдовы.
Незадолго до провозглашения Гагаузской Республики Верховный Совет Молдовы окончательно отказал гагаузам в праве на самоопределение в форме автономии. Гагаузов объявили некоренным населением юга Молдовы, их именовали этнической группой, проживающей на территории, исконно принадлежавшей молдаванам. Провозглашение Гагаузской Республики в этой ситуации было единственно верным решением. Гагаузская Республика просуществовала в формате непризнанного независимого государства до 1994 года, а затем мирно интегрировалась в состав Молдовы. Произошло это после того, как парламент Республики Молдова принял закон об особом правом статусе Гагаузии, наделявший территории компактного проживания гагаузов на юге страны политической автономией, в рамках которой Гагаузия имеет свой парламент — Народное собрание — и исполнительный орган, возглавляемый башканом, избираемый населением Гагаузии на всеобщих выборах.
У руководства страны хватило мудрости не начинать вооруженный конфликт, как это произошло в Приднестровье, и найти политическую формулу, по которой автономия и центр смогли существовать без конфликтов. Однако мирное сосуществование продлилось только до 2009 года, начиная с которого у власти в Молдове находятся проевропейские политические силы. С этого момента начинается новый этап напряженности между Кишиневом и столицей автономии Комратом. Вызван конфликт прежде всего тем, что подавляющее большинство населения Гагаузии в геополитическом плане однозначно ориентировано на расширение сотрудничества с Россией во всех областях — политической, экономической, культурной.
Население Гагаузии однозначно видит духовное руководство в лице Русской православной церкви и Московского патриархата и отвергает все попытки внести какие-либо изменения в существующее положение. В 2014 году в автономии прошел референдум, на котором 96% проголосовавших высказались за вхождение Молдовы в Таможенный союз, а 98% — за провозглашение независимости Гагаузии, в случае если Республика Молдова утратит свой суверенитет. Естественно, в этих обстоятельствах конфронтация с проевропейским руководством Молдовы стала неизбежной, и при нынешней власти ситуация обострилась до предела. У Санду, победившей на президентских выборах 2020 года, не сложились отношения и с предыдущим башканом автономии Ириной Влах. А когда в мае 2023 года башканом была избрана Евгения Гуцул, между центром и автономией началась открытая вражда. Во многом это объясняется тем, что Евгения Гуцул избрана от ведущей оппозиционной партии «Шор», которая была во главе многотысячных протестов против режима Санду.
Действия властей Молдовы демонстрируют, что Кишинев поставил своей целью смену главы исполнительной власти автономии. Причем для достижения этой цели Санду готова использовать любые методы, включая «торпедирование» инициатив башкана и Народного собрания Гагаузии.
Под предлогом проводимой проевропейской властью судебной реформы предполагается расформировать Апелляционный суд в столице автономии Комрате и перевести все судопроизводство в соседние районы Молдовы. Это ущемляет интересы автономии и ее населения и противоречит закону, согласно которому была создана Гагаузия.
Кишинев начал проводить политику раскола гагаузского общества — организовываются встречи с мэрами населенных пунктов, на которых местным властям обещается поддержка в обход властей автономии. Но подобная политика не срабатывает: например, мэры возмущены тем, что Минюст Молдовы не пригласил на встречу по судебной реформе в Комрате башкана Е. Гуцул и депутатов Народного собрания Гагаузии.
Антикоррупционная прокуратура Молдовы, которую возглавляет дочь одного из главных спонсоров избирательной кампании Санду 2020 года, открыла уголовное дело против Евгении Гуцул, обвиняя ее в незаконном финансировании предвыборной кампании. Гагаузия находится под колоссальным давлением Кишинева. Президент Санду пытается запугать главу Гагаузии через подконтрольные суды в надежде на то, что та не будет успевать выполнять свои обязанности.
Власти Кишинева не позволили автономии самостоятельно закупать для ее жителей природный газ по ценам в два раза ниже, чем это делает государственная компания Energocom, которую в своих коррупционных схемах использует руководство правящей партии PAS.
Также кишиневские власти препятствуют выплате дополнительных пособий пенсионерам Гагаузской автономии. Эти выплаты осуществляются через карты «Мир» российского Промсвязьбанка. По указанию молдавской Службы информации и безопасности (СИБ) сайт Промсвязьбанка был заблокирован в Республике Молдова. Блокировка сайта не поможет лишить гагаузских пенсионеров этих доплат: они будут применять ВПН и пользоваться запрещенными приложениями, но отношение к Санду и ее режиму после этого только ухудшится. Доплаты пенсионерам Гагаузии стали возможны благодаря наличию у автономии политической обособленности и возможности, а главное — желания сотрудничать с Россией.
Это желание проявляется не только в декларациях Евгении Гуцул, но и в ее многочисленных встречах с руководителями различных российских регионов — от Санкт-Петербурга до Краснодара — и с председателем Совета Федерации РФ Валентиной Матвиенко, а на полях Всемирного фестиваля молодежи в Сочи состоялась встреча Евгении Гуцул с Владимиром Путиным. Результатом этих встреч стало разблокирование поставок на российский рынок продукции гагаузских сельхозпроизводителей.
Да и само руководство Гагаузии не сидит без дела: в автономии за последний год осуществлен целый ряд серьезных инфраструктурных проектов: строятся дороги, ремонтируются школы и детские сады. В этом году к годовщине провозглашения Гагаузской республики в Конгазе, официально признанным самым крупным селом Европы, открыт детский парк «Гагаузия-лэнд», в котором дети со всего юга Молдовы смогут проводить время и развлекаться. Этот проект являлся предвыборным обещанием Евгении Гуцул и был реализован, несмотря на все препятствия, чинимые центральными властями Молдовы (строительство всячески тормозили различные госорганы от полиции до налоговой и экологической инспекций, а таможенная служба более двух месяцев не выпускала завезенные для парка аттракционы).
Действующая центральная власть Молдовы испортила отношения с властями Гагаузии, не скрывая своего негативного к ним отношения из-за пророссийской направленности. При этом в Кишиневе не считаются с тем, что граждане Молдовы, проживающие в Приднестровье и Гагаузии, заинтересованы в многовекторной политике страны. Односторонняя проевропейская ориентация Кишинева наносит вред экономике этих регионов, ведет к снижению уровня жизни их населения.